Saviez-vous qu'un manquement aux règles de facturation peut vous exposer à une amende allant jusqu'à 75 000 € ?
En tant qu'auto-entrepreneur, comprendre vos obligations comptables n'est pas une option, mais une nécessité absolue pour la pérennité de votre micro entreprise
En effet, les obligations comptables de la micro-entreprise impliquent notamment la tenue d'un livre des recettes, un registre des achats pour les activités de commerce, et des déclarations régulières à l'Urssaf - même en cas de chiffre d'affaires nul.
Avec les réglementations actuelles, les seuils de chiffre d'affaires en vigueur fixés à 77 700 € pour les prestations de services et 188 700 € pour les activités de commerce, et l'obligation d'utiliser un logiciel de facturation certifié (mis en place progressivement à partir du 1er septembre 2026), il est crucial de bien maîtriser ces aspects.
Dans ce guide pratique, nous allons détailler toutes vos obligations comptables en tant qu'auto-entrepreneur et vous donner les clés pour les gérer efficacement au quotidien, sans nécessairement faire appel à un comptable
Les obligations comptables de base en auto-entreprise
En tant qu'auto-entrepreneur, vous bénéficiez d'un régime comptable allégé, mais certaines obligations restent essentielles à respecter. Ces exigences, bien que simplifiées, constituent le socle d'une gestion saine de votre activité.
Livre des recettes
Tout d'abord, vous devez impérativement tenir un livre des recettes encaissées. Ce document chronologique doit mentionner le montant et l'origine de chaque paiement reçu, le mode de règlement (espèces, chèque, virement), ainsi que les références des pièces justificatives.
Pour les ventes au détail ou services aux particuliers inférieurs à 76€, vous pouvez procéder à un enregistrement global en fin de journée.
Registre des achats
Par ailleurs, si vous vendez des marchandises, des fournitures ou des denrées à consommer, ou si vous proposez des prestations d'hébergement, vous devez également tenir un registre des achats. Ce document récapitule chronologiquement vos dépenses professionnelles, avec indication du mode de paiement et des références des justificatifs.
Facturation
En matière de facturation, la rigueur est de mise. Chaque facture émise doit comporter des mentions obligatoires : vos coordonnées complètes, numéro SIRET, mention "EI" (Entrepreneur Individuel), date, numéro de facture, identité du client, description détaillée des produits/services, et montant total.
Si vous bénéficiez de la franchise de TVA, n'oubliez pas d'ajouter la mention «TVA non applicable, article 293 B du CGI».
Délai de conservation
Concernant les documents comptables, la durée de conservation est strictement encadrée : vous devez conserver vos livres comptables et pièces justificatives pendant 10 ans à partir de la clôture de l'exercice concerné.
Compte bancaire
Notez que vous n'êtes pas tenu d'ouvrir un compte bancaire professionnel, sauf si votre chiffre d'affaires dépasse 10 000€ pendant deux années consécutives. Cependant, disposer d'un compte dédié reste fortement recommandé pour simplifier votre gestion.
Si aucune sanction n'est prévue en cas de non-tenue des registres, attention aux falsifications : l'inscription de fausses informations peut vous exposer à 3 ans d'emprisonnement et 45 000 € d'amende. Quant aux manquements aux règles de facturation, ils peuvent entraîner une amende administrative pouvant atteindre 75 000 € pour une personne physique.
Gérer sa comptabilité au quotidien sans comptable
La gestion quotidienne de votre comptabilité sans recourir à un expert-comptable est tout à fait possible grâce au régime simplifié dont vous bénéficiez.
Cependant, certaines tâches régulières doivent être effectuées avec rigueur.
Parmi vos obligations principales figure la déclaration de votre chiffre d'affaires à l'Urssaf. Celle-ci doit être réalisée mensuellement (option par défaut) ou trimestriellement (sur demande). Notez qu'un délai minimum de 90 jours doit s'écouler entre la date de début d'activité et votre première déclaration. Cette déclaration reste obligatoire même en l'absence de revenus - il vous suffira alors d'inscrire la mention "Néant".
Attention aux échéances :
→ pour une déclaration mensuelle, vous devez la soumettre avant la fin du mois suivant,
→ pour une déclaration trimestrielle, c'est avant la fin du mois suivant le trimestre écoulé.
ℹ️ Tout oubli vous expose à une pénalité de 58,9 € par déclaration manquante, avec des majorations supplémentaires de 5 % (mensuelle) ou 15 % (trimestrielle).
Pour faciliter votre gestion au quotidien, adoptez ces bonnes pratiques :
→ Enregistrez immédiatement chaque transaction dans votre livre des recettes, en précisant le montant, l'origine, le mode de règlement et les références des pièces justificatives. Un logiciel comme Jungloo permet d'automatiser ces enregistrements.
→ Totalisez vos recettes tous les mois ou tous les trois mois.
→ Numérotez séquentiellement vos factures pour un suivi plus efficace.
→ Utilisez un classement chronologique pour vos documents (factures, notes de frais).
N'oubliez pas que seules les sommes effectivement encaissées doivent être déclarées, et non celles simplement facturées.
Par ailleurs, les auto-entrepreneurs cotisent sur leur chiffre d'affaires hors taxe, sans possibilité de déduire leurs charges.
Si votre chiffre d'affaires dépasse 10 000€ pendant deux années consécutives, vous êtes tenu d'ouvrir un compte bancaire dédié à votre activité. Ce compte peut être un simple compte courant (pas nécessairement professionnel) mais doit être distinct de votre compte personnel, permettant ainsi de séparer clairement vos transactions personnelles et professionnelles.
Enfin, conservez précieusement tous vos documents comptables pendant 10 ans à compter de la clôture de l'exercice concerné, une obligation légale qui vous protège en cas de contrôle.
Outils et évolutions à anticiper en 2025
L'année 2025 marque un tournant décisif dans les obligations comptables de la micro-entreprise avec plusieurs évolutions majeures à surveiller de près.
Facturation électronique
La plus significative concerne la facturation électronique obligatoire. À partir du 1er septembre 2026, tous les auto-entrepreneurs devront être capables de recevoir des factures électroniques.
Ensuite, dès le 1er septembre 2027, vous serez tenu d'émettre toutes vos factures professionnelles via une plateforme certifiée. Ce changement vise à moderniser l'administration et lutter contre la fraude fiscale.
ℹ️ Attention, une facture électronique n'est pas un simple PDF, mais un document dématérialisé de bout en bout.
TVA
Concernant la TVA, les seuils de franchise évoluent également.
Depuis le 1er janvier 2025, le seuil pour les prestations de services est de 37 500 € (avec une tolérance jusqu'à 41 250 €), tandis que celui pour les activités commerciales s'établit à 85 000 € (tolérance jusqu'à 93 500 €).
Par ailleurs, la sortie du régime de franchise en base de TVA se fera l'année suivant le dépassement du 1er seuil, sans période d'ajustement. Si le seuil de tolérance est dépassé, la franchise en base de TVA cessera de s'appliquer à la date de dépassement de ce seuil de tolérance.
Face à ces nouvelles exigences, des outils de gestion comptable adaptés deviennent indispensables. Plusieurs logiciels, parfois gratuits, proposent des fonctionnalités spécialement conçues pour les auto-entrepreneurs.
Privilégiez ceux qui permettent :
→ L'édition de factures conformes aux mentions légales
→ La tenue automatisée du livre des recettes
→ La préparation à la facturation électronique
À noter que la mesure d'abaissement du seuil de franchise de TVA à 25 000 € prévue dans le budget 2025 a été temporairement suspendue jusqu'au projet de loi de finances 2026. Cette suspension offre un répit aux auto-entrepreneurs pour s'adapter.
Anticiper ces changements dès maintenant vous permettra d'éviter les mauvaises surprises et de rester en conformité avec vos obligations comptables sans nécessairement recourir à un comptable pour entreprise individuelle.
Les obligations comptables d'un auto-entrepreneur peuvent sembler complexes au premier abord. Néanmoins, leur maîtrise reste essentielle pour la réussite de votre activité.
La tenue rigoureuse de vos livres comptables, combinée à des déclarations régulières auprès de l'Urssaf, constitue le socle d'une gestion saine.
Face aux changements majeurs prévus pour 2025-2027, notamment la facturation électronique obligatoire, une préparation anticipée s'avère cruciale. L'utilisation d'outils adaptés et la mise en place de bonnes pratiques comptables dès maintenant vous permettront d'aborder sereinement ces évolutions.
Jungloo permet aux micro-entrepreneurs de suivre leur comptabilité :
→ suivez de près vos recettes et dépenses;
→ facilitez ainsi un éventuel passage au régime réel,
→ stockez des justificatifs dans l'application,
→ vos documents comptables sont disponibles à l'instant T,
→ facilitez vos déclarations URSSAF,
→ et prochainement, profitez d'un outil de facturation conforme à la norme EDI.
Certes, la gestion comptable demande de la rigueur et de l'organisation.
Pourtant, grâce au régime simplifié dont vous bénéficiez, elle reste parfaitement gérable sans l'intervention d'un expert-comptable. L'essentiel est de maintenir une documentation précise et d'effectuer vos déclarations dans les délais impartis.
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